故事发生在夏亚引领吉翁公国军赢得一年战争的平行宇宙。这一历史转折点导致地球联邦与吉翁公国的势力格局剧变。在空中宇宙殖民卫星生活的女高中生天手让叶，与难民少女尼娅安相遇后被卷入非法MS决斗竞技“军团战”，她驾驶着神秘最新型MS“GQuuuuuuX（吉夸克斯）”投身其中，而被通缉的神秘MS“高达”驾驶员修司伊藤也出现在她们面前。自此，少女与少年的相遇，梦想就此交织，宇宙世纪开启了新的未来......

丽莎的童年并不幸福，父亲和母亲的爱情不被家长承认，而父亲按照家族意愿娶的妻子知道他们母女二人之后，雇人不断伤害她们。丽莎只能随着母亲四处躲避。幸好后来遇到了特莱德斯公国的国王，丽莎随着母亲的第二段婚姻成为了特莱德斯的公主，国王和王兄卡尔王子都对她很好。丽莎终究忘不掉过去，于是偷偷跑回泰国想要复仇，伪装成行政秘书的她进入父亲的公司，并且在那里认识了从泰国警署辞职从商的提颇，两个人在工作中慢慢爱上了彼此，可是丽莎的身份让了两个人的爱情看起来不会有结果，而国内叛军想要利用丽莎和王兄卡尔王子都在泰国期间绑架兄妹二