前往宇宙之眼的赛尔号要穿越一处名为雅丹星云洞的危险区域，但星云洞内被一层梦境结界笼罩，赛尔号深陷其中，临危受命的SPT先锋小队前往幻象星找到梦神赫尔墨斯撤销了结界，赛尔号继续前行来到星云洞内的生命树领域，能量告急的赛尔号准备借用生命树的树之灵来补充能量。

在始祖灵兽利用无尽能源替布莱克驱逐了体内的黑暗力量后，无尽能源便消失了。正当赛尔先锋小队感到失望时，派特博士无意发现了幻影金刚的芯片中记录着关于阿瑞斯水晶的传说，于是战神联盟在赛尔先锋小队的协助下踏上了寻找阿瑞斯水晶的征途，经历了重重磨难，战神联盟终于扫平了阻碍，战胜了也想染指水晶的宇宙海盗和邪恶精灵哈迪斯，在一场公平的对决后，雷伊最终以实力赢得了阿瑞斯水晶并找回了无尽能源。

宇宙海盗抓获了圣灵系神兽精灵迈尔斯，迈尔斯在被捕前将幻影宝石交给儿子蒙塔，将它送出了幻影星。圣灵系迈尔斯的求救惊动了远在赫尔卡星的雷伊，雷伊迅速做出了反应前往了幻影星。被海盗追击的蒙塔闯入赛尔号，并意外帮助赛小息赢得赛尔号一年一度的精灵大师杯的选拔赛。得知蒙塔的身世后，赛小息决定和队友阿铁打、卡璐璐一起帮它救出爸爸迈尔斯，众人踏上寻找幻影星的旅程，那么结局到底是什么呢？请大家拭目以待。

宇宙中的螺旋星系有颗美丽的星球——纳斯星球，星球上有一种神奇的果实，一直保护着整个纳斯星的生态平衡。 星球上的阿吉亚部落世世代代都守护着神之树，可是纳斯星上突然潜入了许多宇宙海盗，恰巧赛尔号上的先锋小队成员赛小息，阿铁打，卡璐璐途经此地，他们立刻加入了这场战斗…随着战况升级，四位神奇精灵：电系王者雷伊，暗影之王布莱克，武斗勇士盖亚，绝地武士卡修斯也加入了进来……